Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUSD1Q6UWL2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SUSD1Q6UWL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms