Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNV1Q6PIU1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNV1Q6PIU1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms