Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM88Q6PEY1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM88Q6PEY1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms