Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF549Q6P9A3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF549Q6P9A3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms