Protein–RNA interactions for Protein: Q6P656

CFAP161, Cilia- and flagella-associated protein 161, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP161Q6P656 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CFAP161Q6P656 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CFAP161Q6P656 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms