Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK5Q6P3R8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK5Q6P3R8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms