Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SWSAP1Q6NVH7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWSAP1Q6NVH7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWSAP1Q6NVH7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms