Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC144NLQ6NUI1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms