Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMBOX1Q6NT76 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HMBOX1Q6NT76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms