Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LGALS9CQ6DKI2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LGALS9CQ6DKI2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms