Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG9BQ674R7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG9BQ674R7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG9BQ674R7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms