Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RNF123Q5XPI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RNF123Q5XPI4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms