Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHEQ5VZ18 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHEQ5VZ18 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHEQ5VZ18 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHEQ5VZ18 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHEQ5VZ18 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHEQ5VZ18 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms