Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CHIC1Q5VXU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CHIC1Q5VXU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CHIC1Q5VXU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms