Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH2Q5VUJ6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH2Q5VUJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms