Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5X8

FAM222A, Protein FAM222A, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM222AQ5U5X8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM222AQ5U5X8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM222AQ5U5X8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms