Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
MAGI3Q5TCQ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MAGI3Q5TCQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MAGI3Q5TCQ9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
MAGI3Q5TCQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
MAGI3Q5TCQ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
MAGI3Q5TCQ9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
MAGI3Q5TCQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms