Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH8Q5T0T0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH8Q5T0T0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms