Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPEREQ5SY80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CATSPEREQ5SY80 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CATSPEREQ5SY80 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms