Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C10orf55Q5SWW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms