Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD3Q5JV73 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
FRMPD3Q5JV73 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FRMPD3Q5JV73 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms