Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC4Q5GLZ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC4Q5GLZ8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC4Q5GLZ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms