Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDLIM3Q53GG5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDLIM3Q53GG5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms