Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BBS9Q3SYG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BBS9Q3SYG4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms