Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf59Q2T9L4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf59Q2T9L4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf59Q2T9L4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf59Q2T9L4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf59Q2T9L4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C15orf59Q2T9L4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C15orf59Q2T9L4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C15orf59Q2T9L4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms