Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC142Q17RM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC142Q17RM4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms