Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRNQ16849 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRNQ16849 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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