Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPROQ16827 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPROQ16827 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPROQ16827 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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