Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTN1Q16799 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RTN1Q16799 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RTN1Q16799 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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