Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF239Q16600 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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