Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCSK7Q16549 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK7Q16549 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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