Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DDB1Q16531 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
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DDB1Q16531 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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DDB1Q16531 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
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DDB1Q16531 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDB1Q16531 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
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DDB1Q16531 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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DDB1Q16531 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DDB1Q16531 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
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