Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF56Q15929 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF56Q15929 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF56Q15929 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF56Q15929 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF56Q15929 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF56Q15929 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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