Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC1A5Q15758 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A5Q15758 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A5Q15758 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms