Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPAQ15257 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPAQ15257 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPAQ15257 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms