Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRD3Q15059 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRD3Q15059 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRD3Q15059 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
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