Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC7Q15024 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC7Q15024 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC7Q15024 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms