Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMC1AQ14683 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC1AQ14683 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC1AQ14683 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
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