Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF235Q14590 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF235Q14590 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF235Q14590 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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