Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD9Q14511 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEDD9Q14511 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms