Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COL9A2Q14055 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A2Q14055 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A2Q14055 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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