Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HDAC1Q13547 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HDAC1Q13547 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HDAC1Q13547 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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