Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP3B2Q13367 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
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