Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLN3Q13286 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CLN3Q13286 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CLN3Q13286 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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