Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3FQ13275 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3FQ13275 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA3FQ13275 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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