Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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CBX3Q13185 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBX3Q13185 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CBX3Q13185 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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