Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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FOXD4Q12950 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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FOXD4Q12950 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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FOXD4Q12950 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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FOXD4Q12950 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FOXD4Q12950 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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FOXD4Q12950 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FOXD4Q12950 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXD4Q12950 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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