Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFSWAPQ12872 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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