Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCAPQ12770 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCAPQ12770 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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