Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 BCK2YER167W 2556 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YLR156WYLR156W 345 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YLR159WYLR159W 345 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YLR161WYLR161W 345 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 POP3YNL282W 588 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 TRM10YOL093W 882 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 CUE5YOR042W 1236 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 NAM2YLR382C 2685 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YCF1YDR135C 4548 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 GAL11YOL051W 3246 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YGL036WYGL036W 2730 nt4.49□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 UGA3YDL170W 1587 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 BCH2YKR027W 2298 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 GRS2YPR081C 1857 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 COS7YDL248W 1152 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 COS5YJR161C 1152 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YLR374CYLR374C 390 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YNL174WYNL174W 573 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 VPS45YGL095C 1734 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 HER2YMR293C 1395 nt4.48□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 MMT1YMR177W 1533 nt4.47□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 PDR10YOR328W 4695 nt4.47□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 SYF1YDR416W 2580 nt4.47□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.47□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YKR075CYKR075C 924 nt4.47□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 EGT2YNL327W 3126 nt4.47□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 TRM13YOL125W 1431 nt4.46□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 YJR015WYJR015W 1533 nt4.46□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 NPL4YBR170C 1743 nt4.46□□□□□ -1.69
NFI1Q12216 KRE5YOR336W 4098 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RVB1YDR190C 1392 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RPS13YDR064W 456 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 PUS6YGR169C 1215 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 BUD28YLR062C 378 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MAK3YPR051W 531 nt4.46□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MNL1YHR204W 2391 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RCK2YLR248W 1833 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MRP4YHL004W 1185 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 TIS11YLR136C 858 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 ATP14YLR295C 375 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RNA1YMR235C 1224 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 TOM5YPR133W-A 153 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 KIP3YGL216W 2418 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MET12YPL023C 1974 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 STB3YDR169C 1542 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 ALE1YOR175C 1860 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 SWI1YPL016W 3945 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 NOC2YOR206W 2133 nt4.45□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 PRP9YDL030W 1593 nt4.44□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 SSH4YKL124W 1740 nt4.44□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 SLX8YER116C 825 nt4.44□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 VPS71YML041C 843 nt4.44□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YPT53YNL093W 663 nt4.44□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RDH54YBR073W 2877 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 UBP6YFR010W 1500 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 SUP35YDR172W 2058 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YGL088WYGL088W 366 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 TVP38YKR088C 1014 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 VMA1YDL185W 3216 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MSN4YKL062W 1893 nt4.43□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 HOYDL227C 1761 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 FAA1YOR317W 2103 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YPR003CYPR003C 2265 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 SUT1YGL162W 900 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MMM1YLL006W 1281 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YBL077WYBL077W 432 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 HMT1YBR034C 1047 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 CKS1YBR135W 453 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RCM1YNL022C 1473 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 HRR25YPL204W 1485 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YRB30YGL164C 1323 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 PEP5YMR231W 3090 nt4.42□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 FBP26YJL155C 1359 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MLF3YNL074C 1359 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 SPO1YNL012W 1896 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 UBP10YNL186W 2379 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RAD52YML032C 1416 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RTN1YDR233C 888 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 PHO92YDR374C 921 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 NOP16YER002W 696 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 DCD1YHR144C 939 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 IRC9YJL142C 393 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YJR012CYJR012C 624 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 JLP1YLL057C 1239 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 PRE7YBL041W 726 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 IBD2YNL164C 1056 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 LTO1YNL260C 597 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YNR061CYNR061C 660 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YER137C-AYER137C-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YER159C-AYER159C-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
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